Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Irx1P81068 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Irx1P81068 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms