Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rps29P62274 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms