Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lmo4P61969 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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