Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Vbp1P61759 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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Vbp1P61759 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Vbp1P61759 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Vbp1P61759 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Vbp1P61759 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Vbp1P61759 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Vbp1P61759 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Vbp1P61759 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vbp1P61759 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms