Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhbdl3P58873 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms