Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Snrpa1P57784 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpa1P57784 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms