Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NcstnP57716 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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NcstnP57716 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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NcstnP57716 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NcstnP57716 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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NcstnP57716 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcstnP57716 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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NcstnP57716 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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NcstnP57716 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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NcstnP57716 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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NcstnP57716 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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NcstnP57716 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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NcstnP57716 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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NcstnP57716 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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NcstnP57716 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NcstnP57716 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms