Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Irf5P56477 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf5P56477 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Irf5P56477 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Irf5P56477 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Irf5P56477 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Irf5P56477 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Irf5P56477 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Irf5P56477 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Irf5P56477 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Irf5P56477 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf5P56477 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms