Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rrp1P56183 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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