Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PctpP53808 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PctpP53808 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PctpP53808 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PctpP53808 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PctpP53808 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PctpP53808 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PctpP53808 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PctpP53808 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PctpP53808 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PctpP53808 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PctpP53808 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PctpP53808 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PctpP53808 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PctpP53808 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PctpP53808 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PctpP53808 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PctpP53808 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PctpP53808 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PctpP53808 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PctpP53808 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PctpP53808 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PctpP53808 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PctpP53808 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PctpP53808 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms