Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dbx1P52950 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms