Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apobec1P51908 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms