Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

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Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Srp9P49962 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srp9P49962 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Srp9P49962 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms