Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cav1P49817 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cav1P49817 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cav1P49817 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cav1P49817 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cav1P49817 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cav1P49817 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cav1P49817 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cav1P49817 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cav1P49817 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cav1P49817 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cav1P49817 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cav1P49817 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cav1P49817 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cav1P49817 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cav1P49817 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cav1P49817 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cav1P49817 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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