Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtpreP49446 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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