Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrprbP47758 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SrprbP47758 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SrprbP47758 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SrprbP47758 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SrprbP47758 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SrprbP47758 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SrprbP47758 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SrprbP47758 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SrprbP47758 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrprbP47758 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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