Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Syt1P46096 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Syt1P46096 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Syt1P46096 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms