Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LtbP41155 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LtbP41155 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms