Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtlP38585 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtlP38585 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms