Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TpoP35419 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TpoP35419 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TpoP35419 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TpoP35419 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TpoP35419 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TpoP35419 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TpoP35419 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TpoP35419 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TpoP35419 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TpoP35419 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TpoP35419 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TpoP35419 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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TpoP35419 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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TpoP35419 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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TpoP35419 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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TpoP35419 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TpoP35419 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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TpoP35419 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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TpoP35419 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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TpoP35419 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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TpoP35419 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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TpoP35419 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TpoP35419 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
TpoP35419 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
TpoP35419 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TpoP35419 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TpoP35419 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TpoP35419 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TpoP35419 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TpoP35419 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TpoP35419 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TpoP35419 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TpoP35419 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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