Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Apoc1P34928 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms