Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rom1P32958 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rom1P32958 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rom1P32958 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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