Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Saa4P31532 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Saa4P31532 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms