Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa2P28309 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms