Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pde6aP27664 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pde6aP27664 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms