Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2afxP27661 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2afxP27661 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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