Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxd8P23463 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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