Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Eif3aP23116 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms