Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

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Length 724 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tap1P21958 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tap1P21958 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tap1P21958 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tap1P21958 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tap1P21958 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tap1P21958 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tap1P21958 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tap1P21958 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tap1P21958 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tap1P21958 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms