Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VimP20152 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VimP20152 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
VimP20152 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
VimP20152 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VimP20152 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VimP20152 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms