Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18530 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18530 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18530 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18530 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18530 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18530 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18530 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18530 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18530 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18530 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18530 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18530 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18530 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18530 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18530 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18530 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18530 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms