Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P18524 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P18524 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P18524 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18524 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18524 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18524 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18524 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18524 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P18524 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms