Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsdP18242 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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