Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PtpraP18052 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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