Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Pou4f1P17208 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Pou4f1P17208 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Pou4f1P17208 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pou4f1P17208 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms