Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sptan1P16546 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sptan1P16546 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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