Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcna1P16388 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcna1P16388 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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