Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf271P15620 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms