Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RhoP15409 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhoP15409 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhoP15409 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhoP15409 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhoP15409 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhoP15409 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhoP15409 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhoP15409 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhoP15409 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhoP15409 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhoP15409 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhoP15409 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RhoP15409 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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RhoP15409 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RhoP15409 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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RhoP15409 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhoP15409 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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