Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Vpreb2P13373 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms