Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Cxcl1P12850 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Cxcl1P12850 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Cxcl1P12850 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Cxcl1P12850 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Cxcl1P12850 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Cxcl1P12850 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Cxcl1P12850 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Cxcl1P12850 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cxcl1P12850 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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