Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccl2P10148 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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