Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Csf3P09920 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms