Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxb7P09024 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms