Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P01645 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01645 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P01645 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P01645 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P01645 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms