Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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P01641 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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P01641 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P01641 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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P01641 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
P01641 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01641 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01641 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01641 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01641 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01641 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01641 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01641 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01641 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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P01641 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01641 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01641 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01641 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01641 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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P01641 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01641 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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P01641 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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P01641 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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P01641 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P01641 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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P01641 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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P01641 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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P01641 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P01641 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01641 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01641 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01641 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01641 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P01641 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01641 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01641 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01641 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P01641 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01641 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01641 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01641 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01641 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01641 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01641 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P01641 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P01641 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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