Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sp1O89090 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp1O89090 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp1O89090 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sp1O89090 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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