Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Copb2O55029 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Copb2O55029 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Copb2O55029 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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