Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ChkaO54804 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms