Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Opn1mwO35599 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms